Решение межведомственной комиссии можно оспорить в судебном порядке (ст. 218 КАС РФ). Оспаривание производится согласно главе 22 КАС РФ. Но обжалование решения межведомственной комиссии в суде возможно не позднее 3 месяцев с даты его получения (ст. 219 КАС РФ).

В иске необходимо указать: наименование суда; Ф. И. О. истца, его место жительства, дату и место его рождения, сведения об ответчике — межведомственной комиссии;  доводы и требования. Кроме того к исковому заявлению необходимо приложить копии решения межведомственной комиссии, документов, подтверждающих права на жилье (свидетельства о собственности, договора соцнайма, купли-продажи и т. д.), справки о составе семьи, паспорта заявителя, жалоб жильцов на недостатки жилья, технического плана жилья, решения собственников (нанимателей) о признании дома непригодным для проживания и обращения с заявлением в межведомственную комиссию, документов технической экспертизы.